Pluto Biosciences se lanza para acelerar el descubrimiento científico
Pluto Biosciences se lanza desde el Instituto Wyss de Harvard para acelerar el descubrimiento científico
16 de agosto de 2021
La plataforma de colaboración basada en la nube de la startup combina un diseño intuitivo con un potente análisis bioinformático para investigadores de ciencias de la vida.
Por Lindsay Brownell
BOSTON) – El Instituto Wyss de Ingeniería de Inspiración Biológica de la Universidad de Harvard anunció hoy que una nueva startup, Pluto Biosciences (Plutón), se lanzó para comercializar una plataforma de gestión de datos de ciencias biológicas basada en la nube que incorpora tecnología desarrollada dentro de la Iniciativa de Bioanalítica Predictiva del Instituto. .
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Rani Powers, Ph.D., ex miembro del Instituto Wyss y fundadora de Plutón, atribuye su amplia experiencia como científica de laboratorio y como desarrolladora de software a la visión de la plataforma, que tiene como objetivo empoderar a los científicos académicos y de la industria. con sus propios espacios de laboratorio digital. Crédito: Instituto Wyss de la Universidad de Harvard
La plataforma combina un diseño intuitivo con almacenamiento y análisis de datos biológicos nativos dentro de un entorno colaborativo en línea. Con una licencia de la Oficina de Desarrollo Tecnológico de Harvard (OTD), Plutón planea hacer que la tecnología esté más disponible para los investigadores del mundo académico y biotecnológico, ofreciendo un hogar interactivo para todos sus datos de laboratorio en línea. Pluto Biosciences se lanza para acelerar el descubrimiento científico
La plataforma es una creación del ex científico senior de Wyss, Rani Powers, Ph.D., quien ahora es el fundador y CEO de Plutón. Después de liderar varios lanzamientos de productos exitosos en empresas emergentes de software y ciencias de la vida, y trabajar con equipos de científicos en el Instituto Wyss, se inspiró para crear un tipo de plataforma completamente nuevo que hace que el análisis de datos biológicos sea accesible para los laboratorios de investigación de todo el mundo.
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“Nuestra misión es capacitar a cada investigador con su propio espacio de laboratorio digital”, dijo Powers. “Ya sea que sea un investigador principal que intenta resumir e informar resultados experimentales para una subvención, un científico farmacéutico que busca comparar datos con experimentos publicados o un estudiante de posgrado que intenta compartir resultados con un colaborador, la plataforma que construimos en el Instituto Wyss le permite administrar y analizar sus proyectos en un solo lugar, lo que acelera la ciencia y reduce el trabajo intenso «.
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Acelerando el ritmo del descubrimiento
Powers, biólogo molecular de formación, también ha desarrollado software durante más de una década. Sus experiencias tanto en el laboratorio como con conjuntos de datos complejos revelaron que los científicos de muchas organizaciones de ciencias de la vida luchan por administrar, analizar y compartir sus datos experimentales debido a programas de software complicados e incompatibles. Pluto Biosciences se lanza para acelerar el descubrimiento científico
“En las empresas de tecnología, todos los días nos enfrentamos a desafíos técnicos relacionados con el almacenamiento de datos y la experiencia del usuario. Estos no son problemas fáciles, pero se pueden abordar con una combinación de ingeniería y diseño, y resolverlos es crucial para crear productos que aman a los usuarios. Entonces me pregunté, ¿por qué no estábamos aplicando este enfoque al software que usamos para la ciencia? » dijo Powers.
Amir Bein Ph D becario postdoctoral de Wyss comprueba un lote de chips de organos humanos en el laboratorio Credito Instituto Wyss de la Universidad de Harvard
Cuando se produjo la pandemia de COVID-19, Powers vio de primera mano cómo una plataforma como la que imaginó podría acelerar drásticamente el proceso de innovación. “Ver a tanta gente colaborando a gran escala para resolver un problema científico urgente fue increíble: la máquina de innovación del Instituto Wyss funcionaba a toda máquina . Pero debido a que estábamos trabajando con colaboradores en la Universidad de Maryland y Mount Sinai, pasamos mucho tiempo enviando correos electrónicos a las personas para coordinar un plan para generar, almacenar y analizar resultados. Si hubiéramos tenido una plataforma de colaboración centralizada que albergara los datos y resultados experimentales de todos, nuestra capacidad para responder a la pandemia habría sido aún mayor ”, dijo Powers.
La idea se convirtió en un proyecto de cinco meses conocido internamente como OrbitSeq que se lanzó en febrero de 2021 y se convirtió en el primer proyecto de desarrollo de tecnología bajo la Iniciativa de Bioanalítica Predictiva del Instituto Wyss. Además de trabajar directamente con los científicos de Wyss para conocer sus puntos débiles y diseñar la plataforma para abordarlos, también pudo aprovechar el ecosistema de colaboradores y contactos del Instituto Wyss para obtener perspectivas externas y refinar la estrategia para, en última instancia, convertir el proyecto en una puesta en marcha.
Diseño simple, ciencia sofisticada
wers sabía que era crucial diseñar la usabilidad en la plataforma desde el principio. “Aunque existen herramientas de análisis de datos y bioinformática basadas en la nube para que las utilicen los científicos, sus interfaces son innecesariamente complicadas de navegar. De hecho, un director de bioinformática de una universidad me dijo que siempre tenía que ‘aprender qué botones ignorar’ en estas herramientas para obtener el resultado que quería. Las aplicaciones de consumo populares han demostrado que es posible combinar un diseño simple con una computación potente, por lo que esa fue la visión que impulsó la plataforma ”, dijo. Pluto Biosciences se lanza para acelerar el descubrimiento científico
La interfaz de arrastrar y soltar de la nueva plataforma permite a los usuarios cargar datos de ensayo sin procesar de bajo o alto rendimiento y realizar diferentes tipos de análisis para generar visualizaciones que van desde simples gráficos de barras hasta gráficos de volcanes más detallados y mapas de calor, que pueden ser difíciles para personas sin conocimientos específicos de bioinformática o codificación para crear hoy. Más importante aún, los gráficos y otros resultados se almacenan de forma segura en la nube junto con los datos sin procesar utilizados para generarlos, por lo que son completamente reproducibles, compartibles y siempre accesibles cuando sea necesario.
Pero la facilidad de uso y el diseño simple eran solo la mitad de la ecuación. Para proporcionar la máxima utilidad, la plataforma también interactúa con bioinformática de terceros y servicios de secuenciación de próxima generación, eliminando la necesidad de grandes sistemas de transferencia de datos y otros obstáculos comunes que consumen mucho tiempo en el camino del descubrimiento científico y la innovación. Más allá de los datos de un laboratorio individual, la plataforma incluye acceso a miles de experimentos disponibles públicamente para una fácil comparación, lo que permite a los investigadores aprender no solo sobre sus propios resultados, sino también sobre las implicaciones más amplias de su trabajo.
La plataforma que comercializa Plutón permite a los investigadores organizar, compartir y analizar fácilmente sus datos en línea, lo que ahorra un tiempo considerable y acelera el ritmo de la investigación. Crédito: Rani Powers
Éxito temprano, potencial a largo plazo
Plutón se lanzó en julio de 2021, lo que convierte a Powers en miembro de la Clase Lumineers de Wyss de 2021. Durante los próximos meses, Plutón planea expandir la lista de organismos, tipos de experimentos y módulos de análisis que admite su producto, incluido el lanzamiento de nuevas funciones para análisis predictivo e identificación de biomarcadores. El equipo también está implementando algoritmos para realizar comparaciones entre conjuntos de datos. Con el objetivo de tener un impacto en una variedad de organizaciones de ciencias de la vida, creen que Plutón tiene el potencial de acelerar el proceso científico para los investigadores de todo el mundo.
Nuestra misión es capacitar a cada investigador con su propio espacio de laboratorio digital.
“La plataforma que Rani y su equipo han construido no es solo otra herramienta bioinformática, es un ecosistema colaborativo en línea que permite a los científicos compartir y aprovechar los avances de los demás de manera más rápida y sencilla de una manera fluida que realmente no se ha hecho para investigadores de laboratorio antes ”, dijo el director fundador del Instituto Wyss, Don Ingber , MD, Ph.D. «El Instituto Wyss se enorgullece de haber contribuido a este importante avance en la búsqueda para hacer que el análisis y la gestión de datos sea más accesible para los científicos de todo tipo, y estamos emocionados de ver a Plutón lanzado para que otros puedan beneficiarse de esta nueva tecnología». Ingber es también profesor de Biología Vascular Judah Folkman.en la Escuela de Medicina de Harvard y el Hospital de Niños de Boston, y profesor de Bioingeniería en la Escuela de Ingeniería y Ciencias Aplicadas John A. Paulson de Harvard.